東港櫻花蝦島內外知名，也是臺灣自主管理最完善的捕撈漁業，每年11月至隔年5月是作業魚期，除現有禁漁期(6至10月)外，如有漁獲體型過小、漁獲成熟雌蝦比率過高等狀況時，則彈性機動增加禁漁期;即使如此，但多年來超量捕撈，對未來影響不明，研究人員憂心不已。

　　根據“農委會”水試所調查，從2015年起，每日漁獲量限定為9箱(每箱18kg)，東港櫻花蝦的價格穩定維持在每箱5000元左右。今年度櫻花蝦漁獲量為1315公噸，比去年減少約100公噸，但因外銷日本增加獲益，產值比去年增加約8000萬元，東港櫻花蝦漁業今年產值5.3億元，創下歷史新高。

　　水試所表示，東港櫻花蝦已連續多年漁獲量超過1000公噸，作業網次也超過3萬次左右，已超過水試所推估櫻花蝦作業網次及最大持續生產量的1100公噸上限。而已多年超過最大持續生產量漁獲量規模，是否會對此資源造成無法恢復的影響仍不明確。

　　因此研究人員配合櫻花蝦產銷班作業船進港后，一律在東港進行卸貨與公開販售，持續進行漁獲量監測，掌握最新漁獲統計資料，希望能平衡漁業資源評估與產業發展，使櫻花蝦漁業逐步朝總漁獲量管理。