中國水產門戶網報道虹鱒魚疾病常見的有營養性疾病、體外寄生蟲病、水霉病、細菌性爛鰭病、爛腮病、腸炎等，其中以營養性疾病最為常見，其次是小瓜蟲病和三代蟲病。 
　　
　　當魚健康狀況不佳時，魚會離開群體，游到排水處或在池壁、池底緩慢游動。不健康的病魚體色發暗或變黑，攝食遲鈍，食量減少，游泳方式異常或者出現腹部膨脹、腮蓋外張、魚體表面局部浮腫，出現白點和白云狀粘液。魚鰭糜爛，基部充血。肛門擴張、充血或有糞便粘著等現象。通過解剖可以看到魚體內部器官也出現了異常癥狀。腎臟、肝臟變色，形狀變異，胃腸充滿粘液等。 
　　
　　虹鱒魚病的防治應采取綜合防治措施，寓防病于管理之中，主要措施有： 
　　
　　1、選用體質健壯，抗病能力強的優良魚種。　 
　　
　　2、提高池水溶氧量，保持水體清潔衛生。 
　　
　　3、投喂新鮮、適口的全價配合顆粒飼料。 
　　
　　4、堅持魚體入池消毒，發病季節還要進行水體消毒，消滅病源，適時投喂藥餌進行預防。 
　　
　　5、細心觀察，發現病情及時診治，并把病魚單獨飼養。營養性疾病要從改善飼料入手，投喂適口、營養全面的飼料。 
　　
　　6、在飼料中添加一定數量的代黃粉等中藥，可有效預防寄生蟲和細菌性疾病。 
　　
　　7、在夏季，要適時增氧，增加水體溶氧量，防止魚種浮頭。 
　　
　　只要我們掌握了虹鱒魚的生活規律，并能嚴格按照科學的養殖方法進行管理，虹鱒魚養殖業必將會帶來良好的經濟效益。