網箱設置水域的選擇以及網箱設置的密度和排列方式，直接關系到網箱內魚類的生長狀況。應當從水域水質優劣、天然餌料供應情況、水溫和管理條件等因素綜合考慮確定。

　　1.網箱設置水域的選擇

　　應當綜合考慮下列因素：
　　①利用天然餌料飼養鰱魚、鳙魚的網箱，應選擇靠近居民點和附近農田多的水域，以保證水質較肥沃、天然餌料(浮游生物)較豐富。
　　②選擇避風、向陽、水面寬闊、日照條件較好的場所。這樣的水域水溫較高，有利于魚類生長，還可避免大風浪和汛期洪水危害網箱。
　　③避開主要航道。在壩前、閘口、主河道以及流速超過0.1米/秒的水域，都不宜設置網箱。設置網箱水域的深度，以水庫最低水位時水深不少于3米為宜。網箱底部距庫底要有一定的高度，以防網箱擱淺。

　　2.網箱的排列方式

　　網箱最好采用“品”字形或梅花形排列，這樣網箱之間能錯開位置，有利于魚類生長。網箱的間距應盡可能大，最好在20米以上。大型水庫若選用串聯式網箱，每組串聯不要超過6個，兩組間距不得少于500米。此外，還要考慮網箱設置的密度問題，若網箱設置密度過大，天然餌料供不應求，魚類生長會受到抑制；若網箱設置密度過小，則不能充分發揮水域的生產潛力。設置網箱時應因地制宜，靈活掌握。