清池即清除淤積于池中的殘餌、鋸緣青蟹排泄物、生物尸體等有機物，因這些有機物是造成蟹池老化和低產的原因之一，大量的有機物在冬季分解很慢，翌年進水后隨著水溫的升高，便大量分解，既消耗大量溶解氧，又產生各種有毒物質，輕者影響鋸緣青蟹的生活和生長，重者則可造成鋸緣青蟹的死亡。因此，老的養成池，尤其是養殖密度較高的池塘，最好是每茬養殖都進行一次清淤工作。

    具體方法是：當鋸緣青蟹收獲之后，應敞開水閘，讓海水反復沖洗池塘，洗去池內的有機沉積物和溝底的淤泥。然后排干池水，封閉閘門，曝曬池底，使殘留的有機物進一步氧化分解，污染程度較嚴重的精養池，應組織人力或使用吸泥泵，將淤泥挖出池外。

    在清淤的同時，還應進行池塘的維修工作，比如：修理堤壩、閘門和防逃設施，清整池底和溝渠，堵塞漏洞等。

    除害主要是清除池內有害的致病生物、捕食性生物、爭食性生物及其他有害生物。清除敵害生物的主要措施有三：一是收蟹后將池水排干，封閘曝曬，冰凍一冬，讓各類生物基本死去；二是翌年注水時，閘門設置嚴密的濾水網，防止有害生物進入池中；三是在蟹苗放養前，進行藥物清塘來殺死敵害生物。